학 습 목 표
- OBO Foundry의 핵심 원칙과 생태계 구조를 설명한다.
- MFO의 핵심 설계(과정·성향 분리)를 확인한다.
- Cognitive Atlas와 MFO 두 전통을 비교하고 실습의 자리를 정한다.
OBO Foundry — 규약이 만든 생태계
생물의학은 도메인 온톨로지가 가장 성공한 분야다. 유전자 기능의 Gene Ontology를 필두로 수백 개의 온톨로지가 서로 연결되어 돌아간다. 이 생태계를 가능하게 한 것이 OBO Foundry — 온톨로지들의 공동체이자 규약집이다. 원칙 몇 가지만 추리면 이렇다. 개방 — 누구나 쓰고 고칠 수 있게 공개한다. 공통 형식과 고유 식별자 — 뜻 없는 ID(2-4가 이 전통을 따랐다). 정의 의무 — 모든 항에 자연어 정의를 단다. 공통 상위 구조 — BFO를 뼈대로 쓴다(2-7). 그리고 모토의 직교성(orthogonality) — 한 도메인에 하나의 온톨로지만 두어, 만들기 전에 반드시 기존 것을 찾게 한다. 재사용(3-5)이 개인의 미덕이 아니라 공동체의 규칙이 된 형태다.
MFO — 정신 기능의 엄밀 공학
이 전통 위에서 심리 도메인을 맡는 것이 정신 기능 온톨로지 MFO(Mental Functioning Ontology)다. 헤이스팅스(Janna Hastings)와 동료들이 OBO 모범 규약에 따라 개발했으며, BFO와 일반 의학 과학 온톨로지(OGMS)의 틀 안에 선다. 정신 질환 모듈(MFO-MD)이 따로 있고, 질환 ID는 직교성 원칙대로 Disease Ontology에서 재사용한다.
설계의 핵심은 우리에게 낯익다. 정신 과정(mental process)과 정신 성향(mental disposition)의 분리 — 발생체와 의존 지속체의 구분(2-7)을 정신 영역에 그대로 적용한 것이다. '기억'을 한 클래스로 두지 않고 기억 과정과 기억 성향으로 가르는 실습의 결정은 사실 MFO의 결정을 따라간 것이었다. 철학적 바탕은 쾨스터스와 스미스(Ceusters & Smith)의 실재론 — 온톨로지는 용어가 아니라 실재의 유형을 기술해야 한다는 입장 — 이며, 그 엄밀성이 이 전통의 자산이자 비용이다.
두 전통의 비교 — 그리고 상보성
| 측면 | Cognitive Atlas | MFO |
|---|---|---|
| 수집 방식 | 공동체 위키 — 넓고 빠르다 | 소수 전문가 공학 — 좁고 엄밀하다 |
| 상위 구조 | 자체 경량 구조 | BFO/OGMS — 생의학 생태계와 즉시 호환 |
| 강점 | 과제–개념 연결, 용어 커버리지 | 범주의 엄밀성, 질환 모듈, 추론 가능 |
| 약점 | 일관성 고르지 않음, 범주 느슨(4-2) | 커버리지 좁음, 과제 연결 약함 |
| 스펙트럼 위치(1-5) | 시소러스~경량 온톨로지 | 공리화된 OWL 온톨로지 |
| 실습에서의 역할 | 정렬 대상(개념·과제·measures) | 범주 뼈대의 참조(과정·성향 분리) |
표 1심리 도메인의 두 전통. 어느 쪽이 옳은가가 아니라 — 목적이 다르다(3-1). 실습은 둘을 역할 분담으로 함께 쓴다.
두 전통의 관계자들 스스로 부분 정렬을 시도해 왔다. MFO는 Cognitive Atlas·CogPO와의 정렬을 선언하고 있고, 인지 온톨로지들의 통합 전망을 다룬 공동 논문도 있다. 지형의 교훈은 분명하다. 심리학에는 이미 지도가 여럿 있고, 새 지도의 책임은 기존 지도들과의 자리 관계를 밝히는 것까지다. 실습의 BFO 경량 주석(2-7)은 MFO 쪽 문을, CA 매핑(4-2)은 Cognitive Atlas 쪽 문을 열어 둔다.
판별 연습
문 1직교성 원칙에 비추어, 실습 온톨로지는 "중복 지도"가 아닌가.
답 확인
목적이 다르다. CA·MFO는 연구 공동체의 공유 지도이고, 실습은 학습용 개인 지도다(공유 상대가 자신과 기계 — 1-3). 그리고 직교성의 정신 — 기존 것을 찾고 잇는 것 — 은 정렬로 이행한다. 중복이 되는 경우는 공유 지도를 표방하면서 기존 지도를 무시할 때다.
문 2임상 확장(우울·불안 모듈)을 하게 된다면 두 전통 중 어느 쪽 의존이 커지는가.
답 확인
MFO 쪽이다. 질환은 MFO-MD와 Disease Ontology의 영역이고, 엄밀성 요구도 올라간다(3-1 표의 임상 행). '손상된 기억=단계'라는 OntoClean 분석(3-4)도 그 길목의 준비물이다.
적용: 실습의 좌표 확정
지형 위에서 실습의 자리가 정해졌다. 수집의 넓이는 Cognitive Atlas에 기대고(정렬), 범주의 엄밀성은 MFO·BFO에 기댄다(경량 주석). 형식 수준은 둘 사이 — CA보다 형식적이고 MFO보다 가볍다(1-5의 경로 선언과 일치). 이 좌표는 다음 차시에서 분류 체계들(DSM·HiTOP·RDoC)이 더해지며 지형도의 전체 그림이 된다.
용어 정리
| 용어 | 원어 | 뜻 |
|---|---|---|
| 직교성 | orthogonality | 한 도메인에 하나의 온톨로지만 두는 OBO 원칙 |
| MFO | Mental Functioning Ontology | BFO 기반 정신 기능 온톨로지. 과정·성향 분리가 핵심 |
| MFO-MD | — | MFO의 정신 질환 모듈. Disease Ontology ID 재사용 |
| OGMS | Ontology for General Medical Science | 질병·진단 일반을 다루는 BFO 계열 중간 온톨로지 |
| 실재론(온톨로지) | ontological realism | 온톨로지는 용어가 아니라 실재의 유형을 기술한다는 입장 |
Smith, B. et al. (2007). The OBO Foundry: Coordinated Evolution of Ontologies to Support Biomedical Data Integration. Nature Biotechnology, 25. · Hastings, J. et al. (2012). Representing Mental Functioning: Ontologies for Mental Health and Disease. ICBO. · Ceusters, W., & Smith, B. (2010). Foundations for a Realist Ontology of Mental Disease. J. Biomedical Semantics, 1:10. · Hastings, J. et al. (2014). Interdisciplinary Perspectives on Cognitive Ontologies. Frontiers in Neuroinformatics, 8:62.