2부 구축 · 트랙 4 도메인 읽기: 심리학의 지식 지형

제 3 차 시

MFO와 OBO Foundry — BFO 기반 정신 기능 온톨로지

위키식 Cognitive Atlas의 반대편 — 엄밀 공학 전통의 심리학 온톨로지와, 그것을 떠받치는 공동체 규약을 읽는다.
읽기 약 12분 · 연습 1회

한 도메인에 하나의 온톨로지

직교성 — OBO Foundry의 원칙

같은 도메인에 중복 온톨로지를 만들지 않고, 기존 것을 고치고 재사용한다.

수백 개의 생의학 온톨로지가 한 생태계로 작동하는 비결은
기술이 아니라 규약이다.

학 습 목 표

  1. OBO Foundry의 핵심 원칙과 생태계 구조를 설명한다.
  2. MFO의 핵심 설계(과정·성향 분리)를 확인한다.
  3. Cognitive Atlas와 MFO 두 전통을 비교하고 실습의 자리를 정한다.

OBO Foundry — 규약이 만든 생태계

생물의학은 도메인 온톨로지가 가장 성공한 분야다. 유전자 기능의 Gene Ontology를 필두로 수백 개의 온톨로지가 서로 연결되어 돌아간다. 이 생태계를 가능하게 한 것이 OBO Foundry — 온톨로지들의 공동체이자 규약집이다. 원칙 몇 가지만 추리면 이렇다. 개방 — 누구나 쓰고 고칠 수 있게 공개한다. 공통 형식과 고유 식별자 — 뜻 없는 ID(2-4가 이 전통을 따랐다). 정의 의무 — 모든 항에 자연어 정의를 단다. 공통 상위 구조 — BFO를 뼈대로 쓴다(2-7). 그리고 모토의 직교성(orthogonality) — 한 도메인에 하나의 온톨로지만 두어, 만들기 전에 반드시 기존 것을 찾게 한다. 재사용(3-5)이 개인의 미덕이 아니라 공동체의 규칙이 된 형태다.

MFO — 정신 기능의 엄밀 공학

이 전통 위에서 심리 도메인을 맡는 것이 정신 기능 온톨로지 MFO(Mental Functioning Ontology)다. 헤이스팅스(Janna Hastings)와 동료들이 OBO 모범 규약에 따라 개발했으며, BFO와 일반 의학 과학 온톨로지(OGMS)의 틀 안에 선다. 정신 질환 모듈(MFO-MD)이 따로 있고, 질환 ID는 직교성 원칙대로 Disease Ontology에서 재사용한다.

설계의 핵심은 우리에게 낯익다. 정신 과정(mental process)과 정신 성향(mental disposition)의 분리 — 발생체와 의존 지속체의 구분(2-7)을 정신 영역에 그대로 적용한 것이다. '기억'을 한 클래스로 두지 않고 기억 과정과 기억 성향으로 가르는 실습의 결정은 사실 MFO의 결정을 따라간 것이었다. 철학적 바탕은 쾨스터스와 스미스(Ceusters & Smith)의 실재론 — 온톨로지는 용어가 아니라 실재의 유형을 기술해야 한다는 입장 — 이며, 그 엄밀성이 이 전통의 자산이자 비용이다.

두 전통의 비교 — 그리고 상보성

측면Cognitive AtlasMFO
수집 방식공동체 위키 — 넓고 빠르다소수 전문가 공학 — 좁고 엄밀하다
상위 구조자체 경량 구조BFO/OGMS — 생의학 생태계와 즉시 호환
강점과제–개념 연결, 용어 커버리지범주의 엄밀성, 질환 모듈, 추론 가능
약점일관성 고르지 않음, 범주 느슨(4-2)커버리지 좁음, 과제 연결 약함
스펙트럼 위치(1-5)시소러스~경량 온톨로지공리화된 OWL 온톨로지
실습에서의 역할정렬 대상(개념·과제·measures)범주 뼈대의 참조(과정·성향 분리)

표 1심리 도메인의 두 전통. 어느 쪽이 옳은가가 아니라 — 목적이 다르다(3-1). 실습은 둘을 역할 분담으로 함께 쓴다.

두 전통의 관계자들 스스로 부분 정렬을 시도해 왔다. MFO는 Cognitive Atlas·CogPO와의 정렬을 선언하고 있고, 인지 온톨로지들의 통합 전망을 다룬 공동 논문도 있다. 지형의 교훈은 분명하다. 심리학에는 이미 지도가 여럿 있고, 새 지도의 책임은 기존 지도들과의 자리 관계를 밝히는 것까지다. 실습의 BFO 경량 주석(2-7)은 MFO 쪽 문을, CA 매핑(4-2)은 Cognitive Atlas 쪽 문을 열어 둔다.

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판별 연습

문 1직교성 원칙에 비추어, 실습 온톨로지는 "중복 지도"가 아닌가.

답 확인

목적이 다르다. CA·MFO는 연구 공동체의 공유 지도이고, 실습은 학습용 개인 지도다(공유 상대가 자신과 기계 — 1-3). 그리고 직교성의 정신 — 기존 것을 찾고 잇는 것 — 은 정렬로 이행한다. 중복이 되는 경우는 공유 지도를 표방하면서 기존 지도를 무시할 때다.

문 2임상 확장(우울·불안 모듈)을 하게 된다면 두 전통 중 어느 쪽 의존이 커지는가.

답 확인

MFO 쪽이다. 질환은 MFO-MD와 Disease Ontology의 영역이고, 엄밀성 요구도 올라간다(3-1 표의 임상 행). '손상된 기억=단계'라는 OntoClean 분석(3-4)도 그 길목의 준비물이다.

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적용: 실습의 좌표 확정

지형 위에서 실습의 자리가 정해졌다. 수집의 넓이는 Cognitive Atlas에 기대고(정렬), 범주의 엄밀성은 MFO·BFO에 기댄다(경량 주석). 형식 수준은 둘 사이 — CA보다 형식적이고 MFO보다 가볍다(1-5의 경로 선언과 일치). 이 좌표는 다음 차시에서 분류 체계들(DSM·HiTOP·RDoC)이 더해지며 지형도의 전체 그림이 된다.

용어 정리

용어원어뜻
직교성orthogonality한 도메인에 하나의 온톨로지만 두는 OBO 원칙
MFOMental Functioning OntologyBFO 기반 정신 기능 온톨로지. 과정·성향 분리가 핵심
MFO-MD—MFO의 정신 질환 모듈. Disease Ontology ID 재사용
OGMSOntology for General Medical Science질병·진단 일반을 다루는 BFO 계열 중간 온톨로지
실재론(온톨로지)ontological realism온톨로지는 용어가 아니라 실재의 유형을 기술한다는 입장
이 차시가 기대고 있는 자료
Smith, B. et al. (2007). The OBO Foundry: Coordinated Evolution of Ontologies to Support Biomedical Data Integration. Nature Biotechnology, 25. · Hastings, J. et al. (2012). Representing Mental Functioning: Ontologies for Mental Health and Disease. ICBO. · Ceusters, W., & Smith, B. (2010). Foundations for a Realist Ontology of Mental Disease. J. Biomedical Semantics, 1:10. · Hastings, J. et al. (2014). Interdisciplinary Perspectives on Cognitive Ontologies. Frontiers in Neuroinformatics, 8:62.
트랙 4 · 차시 3MFO와 OBO Foundry